Den 2 mars 2016 beslutade riksdagen att bifalla regeringens förslag i propositionen Patent- och marknadsdomstol (prop. 2015/16:57, bet. 2015/16:JuU10, rskr. 2015/16:159). Ändringarna innebär att domstolsprövningen av immaterialrättsliga-, marknadsföringsrättsliga- och konkurrensrättsliga mål och ärenden ska ske samlat i en särskild domstol i första instans (Patent- och marknadsdomstolen) och en särskild domstol i andra instans (Patent- och marknadsöverdomstolen). Stockholms tingsrätt ska vara Patent- och marknadsdomstol och Svea hovrätt ska vara Patent- och marknadsöverdomstol. Som en konsekvens av förslaget ska Marknadsdomstolen och Patentbesvärsrätten avvecklas och upphöra som myndigheter den 31 augusti 2016.

Regeringen har gett i uppdrag åt myndigheten dels att förbereda en överföring av domstolens uppgifter till Patent- och marknadsdomstolen vid Stockholms tingsrätt och Patent- och marknadsöverdomstolen vid Svea hovrätt den 1 september 2016, dels att förbereda en avveckling av Marknadsdomstolen så att den kan upphöra den 31 augusti 2016 (Fi2015/03493/KO[delvis]). Marknadsdomstolen ska vidta nödvändiga avvecklingsåtgärder så att myndigheten kan upphöra den 31 augusti 2016. Myndigheten ansvarar för avvecklingen fram till dess att den upphör.

Myndigheten ska i Hermes redovisa prognoser med tillhörande kommentarer för 2016. Av kommentarerna ska framgå vilka antaganden som använts i prognosen, vilka osäkerhetsfaktorer som finns och eventuella förändringar av förutsättningarna för myndigheten att bedriva sin verksamhet. Vidare ska förändringar i förhållande till föregående prognostillfälle samt den av myndigheten beslutade budgeten kommenteras. Vid väsentliga prognosavvikelser ska myndigheten även ange orsakerna till dessa, samt vilka åtgärder som vidtagits eller planeras att vidtas för att verksamheten ska bedrivas enligt plan inom ramen för tilldelade medel. Prognoserna ska lämnas senast den 20 januari, 19 februari, 3 maj och 1 augusti 2016.

Marknadsdomstolen ska senast den 30 juni 2016 till Regeringskansliet (Finansdepartementet och med kopia till Justitiedepartementet) redovisa hur avvecklingsarbetet fortskrider, bl.a. avseende personalsituation, lokalfrågor, arkivfrågor och resursåtgång. Redovisningen ska omfatta dels en redovisning av ställningen på räntekontot respektive övriga tillgångar och skulder, dels en bedömning av mål och ärenden i balans som beräknas föras över till Patent- och marknadsdomstolen respektive Patent- och marknadsöverdomstolen den 1 september 2016.

Överlåtelse av Marknadsdomstolens tillgångar och skulder till Domstolsverket ska ske till bokfört värde enligt 5 kap. 5 och 8 §§ förordningen (2000:605) om årsredovisning och budgetunderlag. Marknadsdomstolen har ansvaret för sina tillgångar och skulder till och med den 31 augusti 2016 och Domstolsverket övertar ansvaret från och med den 1 september 2016.

Avtal kopplade till uppgifter, som från och med den 1 september 2016 ska utföras av Sveriges Domstolar, ska överföras till Domstolsverket. Övriga gällande avtal ska omförhandlas med beaktande av affärsmässighet samt juridisk och verksamhetsmässig kompetens.

Omstruktureringskostnader som avser den period Marknadsdomstolen fortsatt bedriver verksamhet, dvs. till och med att myndigheten upphör den 31 augusti 2016, ska belasta myndighetens förvaltningsanslag.

Marknadsdomstolen får vidarefakturera kostnader, som härrör till avvecklingen av myndigheten och som inte ryms inom Marknadsdomstolens anslag, till Domstolsverket.

Förvaltningsanslaget ska inte belastas med avsättningar för omstruktureringar som finns kvar i årsredovisningen 2016 och som ska regleras perioden efter den 31 augusti 2016.

Utgifter för särskilda åtgärder och ersättningar till personal som är föremål för avveckling, utöver dem som finansieras av Trygghetsstiftelsen och/eller följer av gällande kollektivavtal, får inte finansieras från de medel som myndigheten disponerar.

Marknadsdomstolens årsredovisning ska lämnas senast den 30 november 2016. Årsredovisningen ska inte innehålla en resultatredovisning, finansieringsanalys och sammanställning över väsentliga uppgifter enligt bestämmelserna i förordningen (2000:605) om årsredovisning och budgetunderlag. Myndigheten ska i årsredovisningen inte heller lämna jämförelsetal för resultaträkning, balansräkning och noter. I årsredovisningen ska en beskrivning av resultaten av verksamheten under den gångna perioden lämnas liksom en detaljerad särredovisning av kostnaderna för avvecklingen och hur de finansierats samt hur eventuell övertalig personal respektive tillgångar och skulder har omhändertagits.