Regeringen har gett i uppdrag åt myndigheten dels att förbereda en överföring av domstolens uppgifter till Patent- och marknadsdomstolen vid Stockholms tingsrätt och Patent- och marknadsöverdomstolen vid Svea hovrätt den 1 september 2016, dels att förbereda en avveckling av Marknadsdomstolen så att den kan upphöra den 31 augusti 2016 (Fi2015/03493/KO[delvis]). Uppdraget har getts med förbehåll för riksdagens godkännande i nödvändiga delar.

Myndigheten ska i Hermes redovisa prognoser med tillhörande kommentarer för 2016. Av kommentarerna ska framgå vilka antaganden som använts i prognosen, vilka osäkerhetsfaktorer som finns och eventuella förändringar av förutsättningarna för myndigheten att bedriva sin verksamhet. Vidare ska förändringar i förhållande till föregående prognostillfälle samt den av myndigheten beslutade budgeten kommenteras. Vid väsentliga prognosavvikelser ska myndigheten även ange orsakerna till dessa, samt vilka åtgärder som vidtagits eller planeras att vidtas för att verksamheten ska bedrivas enligt plan inom ramen för tilldelade medel. Prognoserna ska lämnas senast den 20 januari, 19 februari, 3 maj och 1 augusti 2016.