Signalspaningsnämnden ska senast den 1 mars 2010 lämna en årsredovisning för verksamheten till och med den 30 november 2009 i enlighet med förordningen (2000:605) om årsredovisning och budgetunderlag. Nämnden har efter tidpunkten för ledamöternas entledigande ett fortsatt ansvar för att lämna en slutlig årsredovisning. Redovisningen ska lämnas till regeringen med kopior enligt Ekonomistyrningsverkets föreskrifter till 1 kap. 3§ förordningen (2000:605) och skrivas under av den avgående nämnden. Nämndens ansvar omfattar även hantering av revisionsberättelse och rapporter från Riksrevisionen med anledning av den slutliga årsredovisningen enligt 13 § verksförordningen (1995:1322).

Överlåtelse av Signalspaningsnämndens tillgångar och skulder till Försvarsunderrättelsedomstolen ska ske till bokfört värde enligt 5 kap. 5 och 8 §§ förordningen (200:605) om årsredovisning och budgetunderlag. Signalspaningsnämnden har ansvaret för sina tillgångar och skulder till och med den 30 november 2009 och Försvarsunderrättelsedomstolen övertar ansvaret från och med den 1 december 2009.

Signalspaningsnämnden ska förbereda avveckling av myndigheten till den 30 november 2009. Utgångspunkten för uppdraget är att Signalspaningsnämndens befintliga resurser ska tas över av Försvarsunderrättelsedomstolen (dir. 2009:59  Inrättande av Försvarsunderrättelsedomstolen). Den nya domstolen ska kunna inleda sin verksamhet den 1 december 2009. Uppdraget gäller med förbehåll för att riksdagen fattar nödvändiga beslut enligt propositionen Förstärkt integritetsskydd vid signalspaning (prop. 2008/09:201). När det behövs ska åtgärder, såsom t.ex. tecknande av avtal, förses med förbehåll att riksdagen fattar nödvändiga beslut.