Avvecklingsmyndigheten för Fiskeriverket disponerar under utgiftsområde 20 Allmän miljö- och naturvård anslaget 1:17 Havs- och vattenmyndigheten anslagsposten 2 för de kostnader som uppkommer i samband med avvecklingen av Fiskeriverket. Anslaget får även användas för avvecklingskostnader som övertagits från Fiskeriverket och som tidigare inte redovisats mot anslag.

Återrapportering ska ske i enlighet med vad som framgår av direktivet för utredningen Avveckling av Fiskeriverket (dir. 2011:46).

Överlåtelse av Fiskeriverkets tillgångar och skulder, till de delar som inte övertagits av Havs- och vattenmyndigheten, Statens jordbruksverk eller Sveriges lantbruksuniversitet, ska ske till bokfört värde enligt 5 kap. 5 och 8§§ i förordningen (200:605) om årsredovisning och budgetunderlag till Avvecklingsmyndigheten för Fiskeriverket. Fiskeriverket ansvarade för sina tillgångar och skulder till och med den 30 juni 2011 och Avvecklingsmyndigheten övertog ansvaret från och med den 1 juli 2011.

Avvecklingsmyndigheten för Fiskeriverket behöver inte i sin slutredovisning lämna en resultatredovisning, finansieringsanalys eller sammanställning av väsentliga uppgifter i årsredovisningen enligt bestämmelserna i förordningen (2000:605) om årsredovisning och budgetunderlag. Inte heller jämförelsetal för balans- och resultaträkning samt noter behöver lämnas. En beskrivning av resultatet av verksamheten ska lämnas liksom en detaljerad särredovisning av kostnaderna för avvecklingen och hur de finansierats samt hur övertalig personal respektive tillgångar och skulder omhändertagits. Avvecklingsmyndigheten upphör den 30 juni 2012. Årsredovisning och slutredovisning för verksamheten ska lämnas senast den 1 september 2012.