Avvecklingsmyndigheten för Fiskeriverket disponerar under utgiftsområde 20 Allmän miljö- och naturvård anslaget 1:17 Havs- och vattenmyndigheten anslagsposten 2 för de kostnader som uppkommer i samband med avvecklingen av Fiskeriverket. Anslaget får även användas för avvecklingskostnader som övertagits från Fiskeriverket och som tidigare inte redovisats mot anslag.

Återrapportering ska ske i enlighet med vad som framgår av direktivet för utredningen Avveckling av Fiskeriverket (dir. 2011:46).

Avvecklingsmyndighetens tillgångar och skulder ska slutligt regleras. Detta sker genom att tillgångar och skulder per den 30 juni 2012 överlåts till bokfört värde enligt 5 kap. 5 och 8§§ i förordningen (2000:605) om årsredovisningen och budgetunderlag till Havs- och vattenmyndigheten. Från och med den 1 juli 2012 överförs även arbetsgivaransvaret för kvarvarande personal i Avvecklingsmyndigheten för Fiskeriverket till myndigheten.

Avvecklingsmyndigheten för Fiskeriverket behöver inte i sin slutredovisning lämna en resultatredovisning, finansieringsanalys eller sammanställning av väsentliga uppgifter i årsredovisningen enligt bestämmelserna i förordningen (2000:605) om årsredovisning och budgetunderlag. Inte heller jämförelsetal för balans- och resultaträkning samt noter behöver lämnas. En beskrivning av resultatet av verksamheten ska lämnas liksom en redovisning av kostnaderna för avvecklingen och hur de finansierats samt hur övertalig personal respektive tillgångar och skulder omhändertagits. Avvecklingsmyndigheten upphör den 30 juni 2012. Årsredovisning inklusive slutredovisning för verksamheten ska lämnas senast den 1 september 2012.